ИИ пишет геномы вирусов, и они оживают: 16 фагов Evo обошли устойчивость E. coli

Кинг работает аспирантом-биоинженером в лаборатории Брайана Хая в Институте Arc, а геномы ему написали языковые модели Evo 1 и Evo 2. Работа вышла в Science 6 августа 2026 года.

Модель собрала не отдельный белок под заказ, а целый организм, который заработал в живой клетке.

Что именно сделала модель

Воронка узкая. Модели выдали около 700 тысяч последовательностей. Биоинформатические фильтры оставили 302 кандидата, синтезировали и собрали 285 геномов, живыми вышли 16. Это 5,6% от синтезированных и 0,002% от всего сгенерированного.

Работали не с чистого листа. Шаблоном взяли ΦX174, изученный вдоль и поперёк фаг с кольцевым геномом на 5386 нуклеотидов и 11 генами. Обе модели дообучили примерно на 14 тысячах геномов Microviridae. У полученных вариантов от 67 до 392 замен, у Evo-Φ2147 идентичность ближайшему природному фагу около 93%.

Главный результат не в одиночных фагах, а в смеси. Коктейль из 16 сгенерированных вариантов быстро пробил устойчивость трёх линий E. coli, невосприимчивых к природному ΦX174, а часть вариантов Evo обогнала природный фаг по приспособленности. Хай формулирует ставку прямо: «Если бактерии получат устойчивость к одному фагу, для лекарства всё кончено».

В феврале 2025 Arc Institute выложила Evo 2, обученную на 9,3 триллиона нуклеотидов с контекстом до миллиона нуклеотидов. Тогда это была модель, которая работает с ДНК как с текстом. Теперь её дообученная версия написала геном, который ожил.