12 сентября 2026 г.
ИИ проектирует белок по форме и цепочке аминокислот: SimpleDesign обучили на 2 млн пар
3 сентября 2026 года исследователи Apple описали SimpleDesign, модель для одновременной генерации аминокислотной последовательности и трёхмерной структуры белка. Для обучения использовали более 2 млн пар «последовательность–структура». В совместном тесте SimpleDesign получила co-designability 0,53/0,74 против 0,30/0,46 у DPLM2 для белков длиной 100–500 аминокислот при γ=0,3.
SimpleFold строила трёхмерную форму по уже известной аминокислотной последовательности. SimpleDesign создаёт последовательность и форму вместе. Авторы оценивали белки длиной 100–500 аминокислот по координатам только атомов Cα, а сворачивание и функции новых последовательностей экспериментально не проверяли.
Следующей вехой для SimpleDesign станет экспериментальная проверка сворачивания и функций созданных последовательностей.
Первоисточник
